潔凈空調系統一般分為三大類：
1、集中式潔凈空調系統 ：在系統內單個或多個潔凈室所需的凈化空調設備都集中在機房內，用送風管道將潔凈空氣配給各個潔凈室。
2、分散式潔凈空調系統：在系統內各個潔凈室單獨設置凈化設備或凈化空調設備。
3、半集中式潔凈空調系統：在這種系統中，既有集中的凈化空調機房，又有分散在各潔凈室內的空氣處理設備。是一種集中處理和局部處理相結合的形式。
人們一般按系統內各潔凈室的潔凈度來命名系統，如稱之為100級凈化空調系統，1000級凈化空調系統等。有時也按系統的末級過濾器的性質來區分，分高效空氣凈化系統，亞高效空氣凈化系統和中效空氣凈化系統。
主要有如下特點
1、在機房內對空氣集中處理，進而送進各個潔凈室。
2、由于設備集中于機房，對噪聲和振動較容易處理。
3、一個系統控制多個潔凈室，要求各潔凈室同時使用系數高。
4、集中處理后的潔凈空氣送入各潔凈室，以不同的換氣次數和氣流形式來實現各潔凈室內不同的潔凈度。
集中式潔凈空調系統適用于工藝生產連續、潔凈室面積較大、位置集中，噪聲要求嚴格的潔凈廠房。一般有如下三種形式：
1、直流式：系統所處理的空氣全部來自室外，處理后送入室內，然后又全部排出室外。該系統方式冷、熱量消耗最大，工程投資和運行費用較高，當潔凈室內散發大量的有害氣體，而局部排風不能解決時，采用該方式。
2、封閉式：該系統所處理的空氣全部來自空調房間本身，循環往復。當潔凈室內無人長期逗留，僅僅為存放或為保證精密儀器正常運行，或一些無需從外界獲得新鮮空氣的特殊場合，可以采用封閉式系統。封閉式系統沒有室外新風，系統消耗冷、熱量最少，但衛生條件最差。
3、混合式：該系統不僅吸取一部分室外新風，而且還利用一部分回風，根據回風形式，有一次系統和二次回風系統。這種系統既能滿足衛生要求，又經濟合理，應用最為廣泛。
